De la începutul pandemiei, testele de diagnosticare au jucat un rol vital în controlul răspândirii SARS-CoV-2, virusul care provoacăCOVID 19.Teste rapide de antigenefectuate acasă sau într-un cadru clinic oferă rezultate în 15 minute sau mai puțin.Cu cât o persoană este diagnosticată mai devreme, cu atât mai devreme poate solicita asistență medicală și se poate izola de ceilalți.Dar când apar noi variante ale virusului, este posibil ca acele variante să nu fie detectate de aceste teste.
Cele mai multe teste rapide de antigen sunt concepute pentru a detecta proteina nucleocapside SARS-CoV-2 sau proteina N.Această proteină se găsește din abundență în particulele virale și în oamenii infectați.Kit de testare rapidăConțin de obicei doi anticorpi de diagnostic diferiți care se leagă de părți diferite ale proteinei N.Când un anticorp se leagă de proteina N dintr-o probă, pe trusa de testare apare o linie colorată sau alt semnal, indicând o infecție.
Proteina N constă din 419 unități structurale de aminoacizi.Oricare dintre ei poate fi înlocuit cu un alt aminoacid prin mutație.Grup de cercetare condus de Ph.D.Philip Frank și Eric Ortlund de la Universitatea Emory și-au propus să investigheze modul în care această modificare unică a aminoacizilor afectează performanța unui test rapid de antigen.Ei au folosit o tehnică numită scanare mutație profundă pentru a evalua simultan modul în care fiecare mutație a proteinei N a virusului afectează legarea la un anticorp de diagnostic.Rezultatele lor au fost publicate în Cell pe 15 septembrie 2022.
Cercetătorii au creat o bibliotecă cuprinzătoare de aproape 8.000 de mutații ale proteinei N.Aceste variante reprezintă mai mult de 99,5% din toate mutațiile posibile.Apoi au evaluat modul în care fiecare variantă a interacționat cu 17 anticorpi de diagnostic diferiți utilizați în 11 teste rapide de antigen disponibile comercial, inclusiv obișnuiți.truse de acasă.
Echipa a evaluat care mutații N-proteinei afectează recunoașterea anticorpilor.Pe baza acestor informații, au creat un „profil de mutație de evadare” pentru fiecare anticorp de diagnostic.Acest profil identifică mutații specifice ale proteinei N care pot afecta capacitatea anticorpului de a se lega de ținta sa.Analiza a arătat că anticorpii utilizați în testele rapide de astăzi recunosc și leagă toate variantele trecute și prezente ale SARS-CoV-2 de îngrijorare și îngrijorare.
Deși mai mulți anticorpi de diagnostic recunosc aceeași regiune a proteinei N, cercetătorii au descoperit că fiecare anticorp are o semnătură unică a mutațiilor de evadare.Pe măsură ce virusul SARS-CoV-2 continuă să sufere mutații și să genereze noi variante, aceste date pot fi utilizate pentru a semnala anticorpii trusei de testare care ar putea trebui reevaluate.
„Identificarea precisă și eficientă a persoanelor infectate rămâne o strategie critică pentru atenuarea COVID-19, iar studiul nostru oferă informații despre viitoarele mutații SARS-CoV-2 care ar putea interfera cu detectarea”, a spus Ortlund.„Rezultatele prezentate aici ne permit să ne adaptăm rapid la acest virus, pe măsură ce noi variante continuă să apară, prezentând implicații clinice și de sănătate publică imediate.”
Context: Mutation Deep Scan detectează mutațiile de evadare în nucleocapsidul SARS-CoV-2 utilizând teste antigene rapide disponibile în prezent.Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, Ortlund EA cell.2022 15 septembrie;185(19):3603-3616.e13.Ministerul de Interne: 10.1016/j.cell.2022.08.010.29 august 2022 PMID: 36084631.
Finanțare: Institutul Național pentru Imagistica Biomedicală și Bioinginerie NIH (NIBIB), Institutul Național de Diabet, Boli Digestive și Renale (NIDDK) și Institutul Național de Alergie și Boli Infecțioase (NIAID), Asociația Americană a Inimii.
NIH Research Matters este o actualizare săptămânală a principalelor rezultate ale cercetării NIH, revizuite de experții NIH.Este publicat de Biroul de Comunicații și Afaceri Publice al Directorului National Institutes of Health.